Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rsph14Q9D3W1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rsph14Q9D3W1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms