Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3V8

Fam227a, Family with sequence similarity 227, member A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227aQ9D3V8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam227aQ9D3V8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam227aQ9D3V8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fam227aQ9D3V8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam227aQ9D3V8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam227aQ9D3V8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam227aQ9D3V8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam227aQ9D3V8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam227aQ9D3V8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Fam227aQ9D3V8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fam227aQ9D3V8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms