Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trmt44Q9D2Q2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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Trmt44Q9D2Q2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Trmt44Q9D2Q2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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Trmt44Q9D2Q2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Trmt44Q9D2Q2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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Trmt44Q9D2Q2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Trmt44Q9D2Q2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Trmt44Q9D2Q2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
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Trmt44Q9D2Q2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trmt44Q9D2Q2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Trmt44Q9D2Q2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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