Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Mrpl53Q9D1H8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Mrpl53Q9D1H8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl53Q9D1H8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl53Q9D1H8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Mrpl53Q9D1H8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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