Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mrpl28Q9D1B9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms