Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Syf2Q9D198 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Syf2Q9D198 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms