Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem53Q9D0Z3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.3 ms