Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I8

Mrto4, mRNA turnover protein 4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrto4Q9D0I8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrto4Q9D0I8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrto4Q9D0I8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms