Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Pbdc1Q9D0B6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pbdc1Q9D0B6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.5 ms