Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Mdm1Q9D067 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Mdm1Q9D067 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms