Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610524H06RikQ9CZU9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
2610524H06RikQ9CZU9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610524H06RikQ9CZU9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610524H06RikQ9CZU9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610524H06RikQ9CZU9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610524H06RikQ9CZU9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610524H06RikQ9CZU9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610524H06RikQ9CZU9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610524H06RikQ9CZU9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610524H06RikQ9CZU9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610524H06RikQ9CZU9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610524H06RikQ9CZU9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
2610524H06RikQ9CZU9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms