Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Polr3eQ9CZT4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Polr3eQ9CZT4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms