Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp11Q9CZJ1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Utp11Q9CZJ1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Utp11Q9CZJ1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Utp11Q9CZJ1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp11Q9CZJ1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms