Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccdc77Q9CZH8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms