Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Klhl35Q9CZ49 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Klhl35Q9CZ49 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms