Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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