Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gins3Q9CY94 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gins3Q9CY94 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms