Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Exo5Q9CXP9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Exo5Q9CXP9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms