Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed5Q9CXE7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmed5Q9CXE7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmed5Q9CXE7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms