Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prdm5Q9CXE0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prdm5Q9CXE0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms