Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Mgme1Q9CXC3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mgme1Q9CXC3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms