Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX92

Gje1, Gap junction epsilon-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gje1Q9CX92 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gje1Q9CX92 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gje1Q9CX92 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms