Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Utp23Q9CX11 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Utp23Q9CX11 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms