Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWR2

Smyd3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, mousemouse

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Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd3Q9CWR2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smyd3Q9CWR2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Smyd3Q9CWR2 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Smyd3Q9CWR2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms