Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV82

2310003L06Rik, RIKEN cDNA 2310003L06 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310003L06RikQ9CV82 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2310003L06RikQ9CV82 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2310003L06RikQ9CV82 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms