Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Sycp2Q9CUU3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Sycp2Q9CUU3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Sycp2Q9CUU3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Sycp2Q9CUU3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms