Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930535I16RikQ9CUI2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930535I16RikQ9CUI2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms