Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Chchd3Q9CRB9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Chchd3Q9CRB9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms