Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Exosc5Q9CRA8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc5Q9CRA8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc5Q9CRA8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc5Q9CRA8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc5Q9CRA8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Exosc5Q9CRA8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms