Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR52

4933400A11Rik, RIKEN cDNA 4933400A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933400A11RikQ9CR52 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933400A11RikQ9CR52 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933400A11RikQ9CR52 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms