Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ska2Q9CR46 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ska2Q9CR46 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms