Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4931417E11RikQ9CR05 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4931417E11RikQ9CR05 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms