Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rer1Q9CQU3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rer1Q9CQU3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms