Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PompQ9CQT5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PompQ9CQT5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms