Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM5

Txndc17, Thioredoxin domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc17Q9CQM5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Txndc17Q9CQM5 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Txndc17Q9CQM5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms