Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdzk1ip1Q9CQH0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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