Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nipsnap3bQ9CQE1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nipsnap3bQ9CQE1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms