Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9CQC3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9CQC3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9CQC3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9CQC3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9CQC3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQC3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQC3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQC3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQC3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQC3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CQC3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQC3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQC3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CQC3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms