Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pkp2Q9CQ73 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pkp2Q9CQ73 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms