Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
4921530L21RikQ9CQ47 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
4921530L21RikQ9CQ47 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms