Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
StambpQ9CQ26 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
StambpQ9CQ26 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
StambpQ9CQ26 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
StambpQ9CQ26 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
StambpQ9CQ26 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms