Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Commd4Q9CQ02 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Commd4Q9CQ02 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms