Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ8

Cmc1, COX assembly mitochondrial protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc1Q9CPZ8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cmc1Q9CPZ8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cmc1Q9CPZ8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmc1Q9CPZ8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmc1Q9CPZ8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmc1Q9CPZ8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmc1Q9CPZ8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmc1Q9CPZ8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cmc1Q9CPZ8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms