Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccdc198Q9CPZ1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc198Q9CPZ1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms