Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nsmce3Q9CPR8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms