Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl17Q9CPR4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl17Q9CPR4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl17Q9CPR4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl17Q9CPR4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl17Q9CPR4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl17Q9CPR4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl17Q9CPR4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl17Q9CPR4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl17Q9CPR4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Rpl17Q9CPR4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Rpl17Q9CPR4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rpl17Q9CPR4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms