Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gtf2a1Q99PM3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gtf2a1Q99PM3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms