Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rrbp1Q99PL5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Rrbp1Q99PL5 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Rrbp1Q99PL5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms