Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Smim3Q99PE5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smim3Q99PE5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms