Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rtn4Q99P72 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rtn4Q99P72 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 393.7 ms